La Dirección Adjunta tiene como tarea dirigir, planificar, organizar y controlar los programas y actividades del Hospital Nacional Dos de Mayo, asignando a las unidades orgánicas objetivos y funciones para establecer el control interno previo. Convoca periódicamente a los responsables de los Departamentos y Servicios de atención final en cumplimiento de los objetivos y metas institucionales; así como supervisa, controla y evalúa las actividades asistenciales, administrativas de la institución.